引起腸梗阻的原因分為機械性和非機械性兩種。易於理解，機械性腸梗阻是指腸道堵塞，其原因有三種情況：腸道本身的病變、腸道外擠壓和腸道內異物堵塞。
細分後，腸道本身的病變可以是先天性(如閉鎖、狹窄、發育不全)、炎症性(如克羅恩病、細菌性和放射性小腸炎)、腫瘤(原發或轉移、惡性或良性)、腸套疊等，腸道外壓迫可以是疝(內、外疝)、粘連、先天性條索、扭轉、腫塊壓迫(腫瘤、膿腫、血腫、變異血管)
非機械性腸梗阻為神經肌肉障礙，包括麻痺性腸梗阻、腸段神經節不足(如巨結腸症)；另一個是血管閉塞，如動脈或靜脈。
有趣的是，不同的國家地區和不同年代，不同原因引起的腸梗阻的發生率不同。總體趨勢是嵌頓性外疝引起的相對下降，繼發性腹內粘連相對上升。
