新鮮完整的枇杷不適合存放在冰箱裡。如果放在冰箱裡，會因為水蒸氣過多而變黑，所以枇杷一般存放在乾燥通風的地方。
注：枇杷儲存時，枇杷果實必須與短果柄連線，不得擠壓。
剝皮的枇杷接觸空氣會變色，所以剝皮的枇杷可以儲存在鹽水或糖水、冷水中，可以防止變色，清洗後可以繼續食用。但儲存的枇杷應儘快食用，不能儲存太久。
新鮮枇杷容易腐爛變質，但加工後的枇杷膏、枇杷醬、枇杷酒的儲存時間可以大大延長，喜歡吃枇杷的人可以加工多餘的枇杷，儲存效果更好。
將新鮮乾淨的松針鋪在乾燥的地板或地板上，然後將枇杷鋪在松針上，更適合短期儲存。
若枇杷數量較多，想要長期儲存，可採用溝藏儲存方法。在陰涼乾燥的地方挖一條土溝，長10m深寬約0.9m，鋪上20-30cm厚而乾淨的細砂，放入裝有枇杷的木箱或竹箱，在溝上搭一個人字形支架，保持溝內溫度20℃以下，相對溼度在80-85%之間，可儲存約1個月。
將完整的枇杷放入酒罈或其它罈子中，將稻草鋪在罈子底部，蓋上麻袋或竹簾，也可儲存20天左右。
