生殖器皰疹好發於性活躍期男女，好發於生殖器及會陰部，少數也會累及到肛周、直腸，原發性和複發性生殖器皰疹常見，且有其各自典型的臨牀表現。除此之外，還有以下特殊類型的生殖器皰疹：
1、亞臨牀型生殖器皰疹
臨牀上大約有50%的1型單純皰疹病毒感染者和70%～80%的2型單純皰疹病毒感染者缺乏典型的臨牀表現，被稱爲亞臨牀型生殖器皰疹，是生殖器皰疹最主要的傳染源。其不典型皮損可表現爲生殖器部位的微小裂隙、潰瘍等，常常被忽略。
2、妊娠期生殖器皰疹
妊娠期生殖器皰疹皮損特點無特異性，但容易引起胎兒宮內發育遲緩、流產、早產甚至死產，產道分娩可引起胎兒感染，因此，應該注意選擇生產方式。
3、HIV感染合併生殖器皰疹
此類患者皮損較重，表現爲廣泛、多發、慢性持續性潰瘍及壞死，疼痛劇烈，病程較長，復發更頻繁，對常規阿昔洛韋治療效果不好，常需進行病毒抑制治療。
