羊水污染一般發生在38周後，孕周越大，發生率越高，若超過42周還沒出生，羊水污染的發生概率在30%左右。
羊水污染比較容易發生在胎兒建立排便反射之後，也就是38周後。胎兒37周便已成熟，38周後會建立排便反射，此時胎糞排入羊水中的可能性會增加，更容易使羊水受到污染。一般來說，孕周越大，羊水污染的概率也會越高，如果胎兒超過預產期，特別是超過42周還沒有出生的情況，羊水污染的發生率可以達到30%。
羊水污染通常是因爲胎兒缺氧造成的。如果發生宮內缺氧或宮內窘迫，胎兒的肛門括約肌會變得非常鬆弛，胎糞也會排入到羊水當中，造成羊水污染。長期缺氧容易吸入混合胎糞的羊水，分娩時發生胎糞吸入綜合徵的風險明顯增大，可導致新生兒肺功能下降、新生兒呼吸窘迫症以及肺部感染等併發症。
