囊腫可以掛肝膽外科、甲狀腺外科、普通外科等科室就診，具體就診科室可根據囊腫部位和症狀而定。
1、肝膽外科
若囊腫伴有腹痛、腹脹、嘔吐、噁心等消化道症狀，與肝臟多發性囊腫有關係，可到醫院肝膽外科就診，通過超聲介入、去頂引流改善症狀。
2、甲狀腺外科
若患者伴有呼吸、吞嚥困難等食管、局部器官或神經壓迫性症狀，多屬於甲狀腺多發性囊腫，可到醫院甲狀腺外科就診，通過手術切除囊腫，改善臨牀症狀。
3、普外科
若爲皮脂腺囊腫，且伴有局部疼痛，腫脹等感染性症狀，可到醫院普外科就診，通過外敷藥物進行抗感染治療，症狀可逐漸緩解。
