慢性前列腺炎的治療是一項非常困難的臨牀工作。除了複雜的病因外，原因還與以下因素有關。
1、解剖因素
① 前列腺的位置很深，其分泌物需要通過前列腺管排入尿道，然後才能排出體外。前列腺組織可分爲中域和外周區域。中央區域的前列腺管與射精管平行進入尿道，分泌物容易排出。外周區域的前列腺管與尿道直角或斜進入尿道，分泌物不易順利排出；相反，病原微生物很容易逆行進入腺體。
② 前列腺內局竈性炎症不易診斷，常因病變周圍有腋痕，缺乏血管，是藥物治療不良的原因之一。
③ 前列腺炎症病變不一定與尿道相連，引流不良導致炎症不易消退。
④ 因毗鄰關係慢性前列腺炎常與慢性尿道炎、膀胱炎以及精囊炎同時存在，互爲因果。
2.生理病理因素
① 前列腺表面有一層脂質包膜，大多數抗生素很難通過這層包膜進入前列腺。
② 病變及其周圍硬化不利於藥物擴散。
③ 到目前爲止，前列腺感染的病因尚未明確，預防和治療都很困難。
④ 男青年性興奮性強，性衝動頻繁會導致前列腺反覆充血；未婚男青年缺乏規律的生活會導致前列腺液難以定期引流，導致瘀傷和炎症。
⑤ 慢性前列腺炎並不是完全由細菌感染引起的，還有由病毒、支原體等病原微生物入侵引起的無菌前列腺炎。
顯然，抗生素治療非細菌性感染引起的前列腺炎和無菌性前列腺炎無效，這也是臨牀醫生治療慢性前列腺炎療效差的重要原因。
前列腺液是精液的主要組成部分。性活動或性衝動時，前列腺充血腫脹，分泌物增多。"前列腺充血是年輕人看色情網站的直接後果之一。"
當男性處於性興奮狀態時，前列腺液積聚在後尿道中，不一定排出，但前列腺仍在分泌液體，"如果刺激不夠，就不能排出，但不斷刺激又不斷產生，容易導致後尿道細菌繁殖和化學炎症，如慢性前列腺炎或精囊炎。"據瞭解，長期過度的性興奮會導致前列腺長期充血、腺泡擴張鬆弛、腺體間組織水腫，自然導致無菌性前列腺炎。
