結腸炎疾病確實是有着比較複雜形成原因的一個疾病，慢性結腸炎會遺傳，他還與自身免疫反應、細菌感染等有關。
本病的血緣家庭發病率較高，據研究統計，潰瘍性結腸炎患者的直系血緣親屬中，約15%-30%的人發病。此外雙胞胎的研究表明，單合子比雙合子更容易發病，提示本病的發生可能與遺傳因素有關。
1.自身免疫反應：隨着社會發展，醫學的進步，免疫學的快速成長，有很多不明病因的疾病可以探明。目前，免疫疾病的發病率高，治療困難，已引起重視。多數學者認爲本病屬於自身免疫性疾病。因爲本病併發自身免疫病較多，腎上腺皮質激素能使病情緩解，在部分患者的血清中可查到抗結腸上皮細胞抗體，所以認爲本病的發生可能與自身免疫反應有關。
2.細菌感染：感染是結腸炎病因中是主要病因之一。每當發病時，使用抗生素則有不同程度控制病情和治療效果，這說明與感染有關。當吃了不潔或變質的食物，往往會發生腸道病變。
