導致不孕的疾病多種多樣，除了生殖系統疾病、解剖結構異常、內分泌功能紊亂等原因外，全身性疾病也可引發女性不孕，最常見的為內分泌及代謝方面的疾病。
1、肥胖症引發不孕
隨着現在生活水平的提高，肥胖的發病率越來越高，肥胖會影響內分泌系統的功能，對於女性來説，肥胖症會導致卵巢功能異常，影響排卵而導致不孕，同時還會出現子宮發育不良，性功能異常以及陰道炎等情況。
2、甲狀腺功能障礙
甲狀腺功能障礙引發不孕的機制尚未完全明確，可能與卵巢功能異常、自身免疫功能異常、自身代謝功能異常以及子宮發育異常等因素有關。
3、糖尿病
糖尿病為臨牀上常見病和多發病，可導致糖、蛋白質、脂肪、水以及電解質等代謝紊亂，如糖尿病患者血糖控制不好，可引發全身多器官疾病。女性患者患有糖尿病時容易出現月經紊亂，進而不孕；孕婦患有糖尿病時會出現早產、巨大兒以及死胎。糖尿病造成不孕的機制尚不清楚，可能與自身免疫功能異常以及肥胖等因素有關。
