由於個人體質差異，眼肌麻痺的最佳治療方法的説法不合理，常用治療方法有西醫治療、中醫治療、中西結合治療。
1.西醫治療：眼肌麻痺是指單一肌肉或同一神經支配的肌肉的運動障礙、自主運動及反射運動發生障礙。發病病人有感染或腦血管病病史。西醫主要是神經系統的保護性治療，如果多種維生素的服用，改善局部微循環，增強肌肉作用力。如果三個月以上還是沒有好轉可以考慮手術治療。
2.中醫治療：需辨證論治，如內風較盛可祛風通絡，常用治療方法包括中藥、鍼灸、雷火灸；
3.中西醫結合治療：屬於常用的治療方案，急性期採用西藥治療，配合中醫中藥、鍼灸。
