肛周囊腫的最佳治療時間是一經確診應及早治療。具體如下：
肛周囊腫應早發現、早治療，以免耽誤病情。肛周囊腫大多繼發於皮脂腺囊腫，臨牀主要表現爲肛周局部包塊及觸時疼痛感，由於部分囊腫容易繼發感染而導致肛周膿腫形成，通常患者一旦確診肛周囊腫，需要及時進行手術治療，以免造成膿腫、肛瘻等。
肛周囊腫確診後要徹底清除佔位，術後定期傷口換藥、高錳酸鉀溶液坐浴，以利於疾病的恢復。
