磁共振的工作原理是人體主要成分的80%是水，水中的氫原子是人體內數量最多的物質，每個氫原子都有氫原子核，磁共振診斷器可以使某個組織和部位的氫原子核在強大的磁場空間內共振，使原來雜亂的氫原子核一起按外磁場方向排列運動。立即取消外磁場磁力後，人體內的氫原子在同一組織、同一時間回到原狀態，全過程通過計算機系統收集這些信號，通過數字重建技術轉換成磁共振圖像，用於臨牀診斷。
一、核磁共振的原理
核磁共振是基於原子尺度的量子磁物理性質。具有奇數質子或中子的核，具有內在性質:核自旋轉、自旋轉角動量。核自旋產生磁矩。NMR觀測原子的方法是將樣品放置在強大的磁場下，現代儀器通常採用低温超導磁鐵。核自旋轉本身的磁場，在磁場下重新排列，很多核自旋轉處於低能量狀態。添加電磁場干涉低能源核自旋轉到高能源狀態，回到平衡狀態後發射頻率是NMR信號。利用這樣的過程，可以進行分子科學研究，如分子結構、動態等。
二、核磁共振的優缺點
1、優點:核磁共振顯示的解剖結構逼真，病變組織和正常組織清晰顯示。具有較高的軟組織對比分辨率。沒有骨頭偽影的干擾。不用對比劑就可以進行血流圖像，其多參數圖像比較容易，可以獲得多方位圖像。
2、缺點:肺檢查不如x射線或CT檢查，肝臟、胰腺、腎上腺、前列腺檢查不如CT，但費用高。對腸胃病變不如內鏡檢查。掃描時間長，空間分辨率不理想。由於強磁場，核磁共振不適用於體內有磁金屬和起搏器等特殊患者。
